隨著各地都在建立PCR實驗室，其相關的指導文件主要有：《醫療機構管理條例》《醫療機構臨床實驗室管理辦法》《臨床基因擴增檢驗實驗室管理暫行辦法》《醫療機構臨床基因擴增實驗室管理辦法》http://www.qunfang.net/
  要求臨床PCR實驗室，不但在實驗室設置及儀器設備等硬件上要滿足開展臨床檢驗的條件，而且要求實驗室在日常工作要有文件化的工作程序。
  PCR實驗室在建設的原則上應分為四個單獨工作區域：試劑準備區、標本制備區、擴增區和擴增產物分析區。為了避免交叉污染，進入各個工作區域必須嚴格遵循單一方向原則，即只能從試劑準備區→標本制備區→擴增區→擴增產物分析區，不得逆向流動，并且各區完全獨立，如為一個區套一個區的模式，區間不能直通，則必須建有緩沖間，保證兩個區域間始終處于隔離狀態。

某醫院PCR實驗室平面布局如下圖所示，整個區域有一個公用走廊，每個獨立實驗區設有專門的緩沖區。通過壓差控制，使整個PCR實驗過程中試劑和標本免受氣溶膠的污染，并且降低擴增產物對人員和環境的污染。

有實驗的地方，就不可避免的會出現實驗室污染。實驗室的污染，不僅會影響實驗與科研的質量和效果，還對實驗室工作人員的身體健康有損害，那么，針對PCR實驗室廢水污染，我們又該如何預防與控制呢？

PCR實驗室設計的核心問題是如何避免污染，在實際工作中。常見的有擴增產物的污染；天然基因組DNA的污染；試劑的污染；標本間的污染等等。同時，這一類實驗室所產生的廢水成分復雜，一般都含有鉛、汞、鉻、六價鉻、銅、鋁、錳等重金屬以及大量細菌、病毒、蟲卵等致病病原體，還有化學藥劑、放射性同位素、各種器皿的洗滌而產生的廢水等。 

這些實驗室廢水如果不經過處理就直接排入下水道，會嚴重污染環境，甚至會威脅到人類健康。因此，我們在處理這些廢水時應遵循以下原則：

1、全過程控制原則
  對實驗室各類廢水的產生、處理、排放的全過程應進行控制。

2、減量化原則

  嚴格要求實驗室廢水處理安全管理體系，在廢水和污染物發生原處進行嚴格控制和分離，將各類廢水進行分類收集、源頭控制、清污分流。嚴禁將實驗室廢水直接排入下水道。

3、分類指導原則
  根據實驗室不同性質、規格、廢水排放去向以及排放要求對實驗室廢水進行分類指導。

4、達標與風險控制相結合原則

  全面考慮不同實驗室所產生廢水達標排放的基本要求，同時加強風險控制，從工藝技術、工程建設和監督管理等方面提高應對突發性時間的能力。

5、生態安全原則

  有效去除廢水中有害物質，較少處理過程中消毒副產物產生和控制出水中過高余氯，保護生態環境安全。